Interactions for 1F9Q (chain A)


Structure details

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Chemokine diagram

K A G P H C P T A Q 30s-loop K N G R 40s-loop D L Q A 50s-loopN-term M S S A A G F C A S R P G L L F L G L L L L P L V V A F A S A E A E E D G D L Q C L C V K T T S Q V R P R H N-term I V E L S T I L I A T L L C I K P L Y K K I I K K L L E S
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Interactions found in structure

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Chemokine Residue Generic number Segment Partner Residue Partner Interaction Type
Asp 7 60 N-term LYS 314 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Asp 7 60 N-term CYS 352 PLATELET FACTOR 4 (D) HBAcceptor
Asp 7 60 N-term CYS 352 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Asp 7 60 N-term ILE 351 PLATELET FACTOR 4 (D) Hydrophobic
Asp 7 60 N-term ILE 351 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Asp 7 60 N-term VAL 313 PLATELET FACTOR 4 (D) HBAcceptor
Asp 7 60 N-term VAL 313 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Asp 7 60 N-term THR 316 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Leu 8 61 N-term ILE 342 PLATELET FACTOR 4 (D) Hydrophobic
Leu 8 61 N-term LEU 311 PLATELET FACTOR 4 (D) Hydrophobic
Leu 8 61 N-term LEU 311 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Leu 8 61 N-term LYS 350 PLATELET FACTOR 4 (D) Hydrophobic
Gln 9 62 N-term CYS 310 PLATELET FACTOR 4 (D) HBDonor
Gln 9 62 N-term CYS 310 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Gln 9 62 N-term LEU 311 PLATELET FACTOR 4 (D) HBDonor
Gln 9 62 N-term LEU 311 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Gln 9 62 N-term VAL 313 PLATELET FACTOR 4 (D) Hydrophobic
Cys 10 63 CX GLN 309 PLATELET FACTOR 4 (D) HBAcceptor
Cys 10 63 CX GLN 309 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Leu 11 66 CX GLN 309 PLATELET FACTOR 4 (D) HBAcceptor
Leu 11 66 CX GLN 309 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Leu 11 66 CX LEU 311 PLATELET FACTOR 4 (D) Hydrophobic
Leu 11 66 CX LEU 311 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Leu 11 66 CX LEU 308 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Cys 12 67 CX ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Val 13 68 N-loop GLN 309 PLATELET FACTOR 4 (D) Hydrophobic
Val 13 68 N-loop GLN 309 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Val 13 68 N-loop ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) HBDonor
Val 13 68 N-loop ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Lys 14 69 N-loop ASP 305 PLATELET FACTOR 4 (D) HBDonor
Lys 14 69 N-loop ASP 305 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Lys 14 69 N-loop ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) HBDonor
Lys 14 69 N-loop ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) Cationic
Lys 14 69 N-loop ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Lys 14 69 N-loop GLY 306 PLATELET FACTOR 4 (D) HBDonor
Lys 14 69 N-loop GLY 306 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Thr 16 71 N-loop ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Thr 25 84 B1 LYS 131 PLATELET FACTOR 4 (B) HBAcceptor
Thr 25 84 B1 LYS 131 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Thr 25 84 B1 ASN 247 PLATELET FACTOR 4 (C) HBDonor
Thr 25 84 B1 ASN 247 PLATELET FACTOR 4 (C) VdWContact
Ser 26 85 B1 VAL 129 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Ser 26 85 B1 GLU 128 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Leu 27 86 B1 VAL 129 PLATELET FACTOR 4 (B) HBAcceptor
Leu 27 86 B1 VAL 129 PLATELET FACTOR 4 (B) HBDonor
Leu 27 86 B1 VAL 129 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Leu 27 86 B1 GLU 128 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Val 29 88 B1 SER 126 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Val 29 88 B1 LEU 168 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Val 29 88 B1 LEU 168 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Val 29 88 B1 LEU 167 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Val 29 88 B1 LEU 127 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Val 29 88 B1 LEU 127 PLATELET FACTOR 4 (B) HBAcceptor
Val 29 88 B1 LEU 127 PLATELET FACTOR 4 (B) HBDonor
Val 29 88 B1 LEU 127 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Lys 31 90 30s-loop SER 170 PLATELET FACTOR 4 (B) Cationic
Lys 31 90 30s-loop SER 170 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Lys 31 90 30s-loop LEU 167 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Lys 31 90 30s-loop LEU 167 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Lys 31 90 30s-loop THR 125 PLATELET FACTOR 4 (B) HBDonor
Lys 31 90 30s-loop THR 125 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Ala 32 91 30s-loop SER 170 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Ala 39 99 30s-loop LEU 168 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Leu 41 101 B2 LEU 168 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Ile 42 102 B2 LEU 308 PLATELET FACTOR 4 (D) Hydrophobic
Gly 48 113 40s-loop LYS 246 PLATELET FACTOR 4 (C) VdWContact
Lys 50 115 B3 LEU 308 PLATELET FACTOR 4 (D) Hydrophobic
Ile 51 116 B3 ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Cys 52 117 B3 ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) Hydrophobic
Cys 52 117 B3 ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) HBDonor
Cys 52 117 B3 ASP 307 PLATELET FACTOR 4 (D) VdWContact
Leu 55 120 50s-loop LEU 168 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Tyr 60 125 Helix LEU 168 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Tyr 60 125 Helix LEU 168 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Ile 64 129 Helix ILE 164 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Ile 64 129 Helix ILE 164 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Leu 67 132 Helix LYS 131 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Leu 67 132 Helix LYS 131 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Leu 67 132 Helix VAL 129 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Leu 67 132 Helix VAL 129 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Leu 68 133 Helix ALA 139 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Leu 68 133 Helix VAL 129 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Leu 68 133 Helix LEU 141 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Leu 68 133 Helix LEU 141 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact
Leu 68 133 Helix TYR 160 PLATELET FACTOR 4 (B) Hydrophobic
Leu 68 133 Helix TYR 160 PLATELET FACTOR 4 (B) VdWContact

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