Interactions for 1F2L (chain A)


Structure details

3D view

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Chemokine diagram

Q A S C G K R A 30s-loop R Q H R 40s-loop D P K E 50s-loopN-term M A P I S L S W L L R L A T F C H L T V L L A G Q H H G V T K C N I T C S K M T S K I P V A L N-termC-term A A A L T R N G G T F E K Q I G E V K P R T T P A A G G M D E S V V L E P E A T G E S S S L E P T P S S Q E A Q R A L G T S P E L P T G V T G S S G T R L P P T P K A Q D G G P V G T E L F R V P P V S T A A T W Q S S A P H Q P G P S L W A E A K T S E A P S T Q D P S T Q A S T A S S P A P E E N A P S E G Q R V W G Q G Q S P R P E N S L E R E E M G P V P A H T D A F Q D W G P G S M A H V S V V P V S S E G T P S R E P V A S G S W T P K A E E P I H A T M D P Q R L G V L I T P V P D A Q A A T R R Q A V G L L A F L G L L F C L G V A M F T Y Q S L Q G C P R K M A G E M A E G L R Y I P R S C G S N S Y V L V P V C-term N Q Q Y H I L I I L E T A C F L Q W V K D A M Q H L D R Q
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Interactions found in structure

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Chemokine Residue Generic number Segment Partner Residue Partner Interaction Type
Lys 7 62 N-term LYS 14 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
Lys 7 62 N-term LYS 14 FRACTALKINE (D) VdWContact
Cys 8 63 CX SER 13 FRACTALKINE (D) VdWContact
Cys 8 63 CX LYS 14 FRACTALKINE (D) HBAcceptor
Cys 8 63 CX LYS 14 FRACTALKINE (D) VdWContact
Asn 9 64 CX CYS 50 FRACTALKINE (D) HBAcceptor
Asn 9 64 CX CYS 50 FRACTALKINE (D) HBDonor
Asn 9 64 CX CYS 50 FRACTALKINE (D) VdWContact
Asn 9 64 CX CYS 12 FRACTALKINE (D) VdWContact
Asn 9 64 CX SER 13 FRACTALKINE (D) HBAcceptor
Asn 9 64 CX SER 13 FRACTALKINE (D) VdWContact
Asn 9 64 CX LYS 14 FRACTALKINE (D) HBDonor
Asn 9 64 CX LYS 14 FRACTALKINE (D) VdWContact
Ile 10 65 CX ILE 10 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
Ile 10 65 CX ILE 10 FRACTALKINE (D) VdWContact
Ile 10 65 CX ILE 40 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
Ile 10 65 CX CYS 50 FRACTALKINE (D) VdWContact
Thr 11 66 CX THR 11 FRACTALKINE (D) HBAcceptor
Thr 11 66 CX THR 11 FRACTALKINE (D) HBDonor
Thr 11 66 CX THR 11 FRACTALKINE (D) VdWContact
Cys 12 67 CX ILE 10 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
Cys 12 67 CX ILE 10 FRACTALKINE (D) VdWContact
Lys 14 69 N-loop LYS 7 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
Lys 14 69 N-loop LYS 7 FRACTALKINE (D) VdWContact
Lys 14 69 N-loop ASN 9 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
Lys 14 69 N-loop ASN 9 FRACTALKINE (D) VdWContact
Pro 20 76 N-loop GLN 68 FRACTALKINE (B) Hydrophobic
Pro 20 76 N-loop GLN 68 FRACTALKINE (B) VdWContact
Ala 22 81 N-loop ARG 44 FRACTALKINE (B) VdWContact
Ala 22 81 N-loop ILE 25 FRACTALKINE (B) Hydrophobic
Leu 23 82 N-loop ILE 25 FRACTALKINE (B) Hydrophobic
His 26 85 B1 LEU 48 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
His 26 85 B1 HIS 46 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
His 26 85 B1 HIS 46 FRACTALKINE (D) VdWContact
Gln 28 87 B1 LEU 48 FRACTALKINE (D) HBAcceptor
Gln 28 87 B1 LEU 48 FRACTALKINE (D) HBDonor
Gln 28 87 B1 LEU 48 FRACTALKINE (D) VdWContact
Gln 28 87 B1 ARG 47 FRACTALKINE (D) VdWContact
Ile 40 102 B2 LEU 48 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
Arg 44 106 40s-loop HIS 46 FRACTALKINE (B) VdWContact
Arg 44 106 40s-loop HIS 46 FRACTALKINE (C) Hydrophobic
His 46 113 40s-loop ARG 44 FRACTALKINE (C) VdWContact
His 46 113 40s-loop GLN 28 FRACTALKINE (D) HBAcceptor
His 46 113 40s-loop GLN 28 FRACTALKINE (D) VdWContact
His 46 113 40s-loop HIS 46 FRACTALKINE (C) Hydrophobic
Leu 48 115 B3 ILE 10 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
Leu 48 115 B3 LEU 48 FRACTALKINE (D) Hydrophobic
Leu 48 115 B3 ILE 40 FRACTALKINE (D) Hydrophobic

Interaction pattern search
Search complexes with similar interaction patterns:

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