Interactions for 2L9H (chain C)


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Chemokine diagram

S G K C S N P A 30s-loop R K N R 40s-loop N P E K 50s-loopN-term M K V S A A A L A V I L I A T A L C A P A S A S P Y S S D T T P C C F A Y I A R P L P R A H N-term T Y F Y E K I V V F V T A C V Q K W V R E Y I N S L E M S
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Interactions found in structure

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Chemokine Residue Generic number Segment Partner Residue Partner Interaction Type
Tyr 3 56 N-term ALA 13 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Tyr 3 56 N-term PHE 12 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Tyr 3 56 N-term PHE 12 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Ser 4 57 N-term ALA 13 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Ser 5 58 N-term CYS 50 C-C motif chemokine 5 (D) HBAcceptor
Ser 5 58 N-term CYS 50 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Asp 6 59 N-term ARG 47 C-C motif chemokine 5 (D) HBAcceptor
Asp 6 59 N-term ARG 47 C-C motif chemokine 5 (D) Anionic
Asp 6 59 N-term ARG 47 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Asp 6 59 N-term GLN 48 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Thr 7 60 N-term GLN 48 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Thr 7 60 N-term GLN 48 C-C motif chemokine 5 (D) HBDonor
Thr 7 60 N-term GLN 48 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Thr 7 60 N-term PRO 9 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Thr 7 60 N-term PRO 9 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Thr 7 60 N-term CYS 11 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Thr 7 60 N-term VAL 40 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Thr 8 61 N-term CYS 10 C-C motif chemokine 5 (D) HBAcceptor
Thr 8 61 N-term CYS 10 C-C motif chemokine 5 (D) HBDonor
Thr 8 61 N-term CYS 10 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Thr 8 61 N-term PHE 12 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Pro 9 62 N-term THR 7 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Pro 9 62 N-term MET 67 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Cys 10 63 CX CYS 10 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Cys 10 63 CX THR 8 C-C motif chemokine 5 (D) HBAcceptor
Cys 10 63 CX THR 8 C-C motif chemokine 5 (D) HBDonor
Cys 10 63 CX THR 8 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Phe 12 68 N-loop LYS 33 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Phe 12 68 N-loop LYS 33 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Phe 12 68 N-loop THR 8 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Phe 12 68 N-loop THR 8 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Glu 26 85 B1 LEU 65 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Glu 26 85 B1 GLU 26 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Tyr 27 86 B1 TYR 27 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Tyr 27 86 B1 TYR 27 C-C motif chemokine 5 (A) PiStacking
Tyr 27 86 B1 TYR 27 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Tyr 27 86 B1 TYR 29 C-C motif chemokine 5 (A) HBAcceptor
Tyr 27 86 B1 TYR 29 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Tyr 27 86 B1 GLU 66 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Tyr 27 86 B1 PHE 28 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Tyr 27 86 B1 PHE 28 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Phe 28 87 B1 TYR 27 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Phe 28 87 B1 TYR 27 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Phe 28 87 B1 LEU 65 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Phe 28 87 B1 LEU 65 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Phe 28 87 B1 GLU 66 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Phe 28 87 B1 GLU 66 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Phe 28 87 B1 ILE 62 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Phe 28 87 B1 ILE 62 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Tyr 29 88 B1 TYR 29 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Tyr 29 88 B1 ILE 62 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Tyr 29 88 B1 ILE 62 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Lys 33 94 30s-loop PHE 12 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Lys 33 94 30s-loop PHE 12 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Val 40 102 B2 THR 7 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Val 40 102 B2 GLU 66 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Val 40 102 B2 GLU 66 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Arg 47 114 40s-loop SER 4 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Gln 48 115 B3 MET 67 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Gln 48 115 B3 ASP 6 C-C motif chemokine 5 (D) HBAcceptor
Gln 48 115 B3 ASP 6 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Gln 48 115 B3 SER 4 C-C motif chemokine 5 (D) HBDonor
Gln 48 115 B3 SER 4 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Gln 48 115 B3 SER 5 C-C motif chemokine 5 (D) HBAcceptor
Gln 48 115 B3 SER 5 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Cys 50 117 B3 ASP 6 C-C motif chemokine 5 (D) Hydrophobic
Cys 50 117 B3 ASP 6 C-C motif chemokine 5 (D) VdWContact
Ile 62 129 Helix TYR 29 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Ile 62 129 Helix TYR 29 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Ile 62 129 Helix PHE 28 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Ile 62 129 Helix PHE 28 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Asn 63 130 Helix SER 31 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Asn 63 130 Helix PHE 28 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Asn 63 130 Helix PHE 28 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Glu 66 133 Helix TYR 27 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Glu 66 133 Helix LYS 25 C-C motif chemokine 5 (A) HBAcceptor
Glu 66 133 Helix LYS 25 C-C motif chemokine 5 (A) Anionic
Glu 66 133 Helix LYS 25 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Glu 66 133 Helix VAL 42 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Glu 66 133 Helix VAL 42 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Glu 66 133 Helix GLU 26 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Glu 66 133 Helix PHE 28 C-C motif chemokine 5 (A) Hydrophobic
Glu 66 133 Helix PHE 28 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact
Met 67 134 Helix GLN 48 C-C motif chemokine 5 (A) VdWContact

Interaction pattern search
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